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更に調べた。
「ffmpeg.exeを使って音声を取得」は効果無しだった。
extractwave.exe関連のオプションは、選んでエンコードしようとしたらエラーになったり強制終了した。
「常にffmpegで前準備してから変換する(特殊ファイル用)(低速)」を有効にすれば、タイミングはバッチリだ。
ただ、この段階で音声も変換されてしまい、ここで劣化が発生してしまう。
再変換時の問題ではないので、いじれる部分はこれだけだ……。
一応、wavを手で切り出して、手で微妙に編集してから連結すればいけるとは思うが、毎回それをするのも微妙だ。

• 諦めて、音声ずれ有りのままにしとく。
  • 用途が用途なので、ずれてるのは致命的。
• 諦めて、音声劣化のままにしとく。
  • できれば、少しでもマシなほうが……。
• 最新版ffmpeg.exeでは劣化しなくなっているのを期待して、自前で最新版に入れ替えてみる。
  • 直ってるとは限らない。
  • mingw構築環境を入れて自前でコンパイルするの面倒。
  • しかし、これぐらいは、やってみるか……。